Музей расположен на 3-м этаже жилого дома, построенного во II пол. XVIII в. в последней квартире писателя, в которой М. М. Зощенко прожил 4 года с 1954 по 1958 год.

В 1934 г. дом был надстроен двумя этажами, в которых расположился первый в городе писательский кооператив. В разные годы одновременно с Зощенко в надстройке жили Н. Заболотский, В. Каверин, Б. Корнилов, Н. Олейников, В. Рождественский, М. Слонимский, В. Стенич, Б. Томашевский, О. Форш, Е. Шварц, Б. Эйхенбаум и многие другие литераторы.

Музей открылся 10 августа 1992 г. , как филиал Литературно-мемориального музея Ф. М. Достоевского. С 1 июля 1993 г. -- Государственный литературно-мемориальный музей М. М. Зощенко.